Como medida de acompanhamento dos efeitos provocados pelos projectos alvo de Avaliação de Impacte Ambiental ou Avaliação de Incidência Ambiental são habitualmente implementados Planos de Monitorização dos Impactes Ambientais, que consistem na recolha sistemática de dados específicos ao longo das diferentes fases do projecto (construção e exploração) com vista à aferição os impactes previstos e/ou de impactes inesperados.

Num campo mais estratégico os planos e programas alvo de Avaliação Ambiental Estratégica também são, de acordo com a lei em vigor, submetidos a Planos de Seguimento e Controlo, em que se efectua uma monitorização, pelo menos anual, dos efeitos da execução do plano ou programa.

A Sinergiae Ambiente assegurou dezenas de Planos de Monitorização nas mais diversas temáticas (Arquelogia, Ruído, Recursos Hídricos, Fauna, Flora e Habitats, etc.),  de Projetos e de Planos.